Régesrégen az Armada, Energon és Cybertron három különböző Univerzumként létezett, ahol különböző módokban tartottak az ádáz harcok az Autobotok és a Deceptconok között.
Egy nap valamlyik távoli Univerzumban feltámadt Unicron, aki életveszélyes pusztításba kezdett bele, csakhogy elkövetett egy hibát. Mikor végső összecsapásnál megküzdött az Univerzum megmentésére felélesztett Primusszal, megnyitotta a fekete lyukat, hogy abba beletaszítsa ellenfelét.
A fekete lyuk nem szippantotta be, sőt. Kisebb fekete lyukakká esett szét, amik a másik oldalról beszippantottak ide mindent. Így a három Univerzum egybeolvadt és klcsönös téridőzavarokat keltett, így amiből kettő volt, egybeolvadt, és minden létező Transformer és élőlény egy helyre kerültek. Még új bolygók és más fajok is létrejöttek ezáltal.
Az Unicron eltűnt, Primus egybeolvadt Cybertronnal. Az Autobotok, akik eddig nem találkoztak soha egymással, összefogtak, hogy az Univerzumok egybeolvadása után felvegyék a harcot az összes Decepticon ellen, akik az új Univerzum leigázására szintén összefogtak és meggyarapították a saját zónáikat.
A mai napig tart a háború a két tábor között. az évek során kialakultak bizonyos zónák és más újabb helyek. Hogy az Autobozok és a Decepticonok nagyobb sikereket érhessenek el, számítanak az újabb generációkra és szövetségekre is.
Vajon ki fogja ezt a háborút megnyerni?